Ненад Стојиљковић рођен је 2. фебруара 1980. године у Нишу. Основну и средњу школу завршио је у родном граду са одличним успехом.

Основне студије започео је школске 1999/2000. године на Филозофском факултету – група за физичку културу Универзитета у Нишу. Дана 22. новембра 2005. године завршио је студије са просечном оценом 9,57 и оценом 10,00 на дипломском испиту. Назив дипломског рада: „Успех и учешће наших спортиста на Зимским олимпијским играма“.

Посдипломске студије уписао је 2005/2006. године на Факултету физичке културе Универзитета у Нишу. Био је редован студент чије се студије финансирају на терет буџета. Године 2007. добио је републичку стипендију Министарства науке и технолошког развоја Републике Србије. Био је ангажован на пројекту Министарства науке „Култура мира, идентитети и међуетнички односи у Србији и на Балкану у процесу евроинтеграције“ под вођством проф. др Љубише Митровића. Школске 2007/2008. године уписао је докторске студије на Факултету спорта и физичког васпитања у Нишу, где је положио све испите са просечном оценом 9,69.

Докторску дисертацију под насловом „Историјски аспекти методологије научног истраживања у спорту и физичком васпитању“ одбранио је 19. фебруара 2015. године на Факултету спорта и физичког васпитања Универзитета у Нишу (ужа научна област: Научне дисциплине у спорту и физичком васпитању).

Постдокторске студије у трајању од шест месеци завршио је на Кинезиолошком факултету у Загребу у школској 2018/2019. години.

Први радни однос засновао је 2006. године као професор физичког васпитања у Спортском центру „Чаир“ у Нишу. Од јануара 2008. године ради као сарадник у звању асистента на предмету Историја физичке културе на Факултету спорта и физичког васпитања Универзитета у Нишу. Такође је ангажован као асистент на предметима Олимпијско васпитање и образовање, Историја спорта и Активности у природи.

Од 2013. године ангажован је као асистент на предмету Теорија спорта, а од 2014. године на предмету Научно-истраживачки рад у спорту и физичком васпитању. Од 2015. године изабран је у звање доцента за предмете Методика истраживачког рада у спорту и физичком васпитању, Научно-истраживачки рад у спорту и физичком васпитању и Методологија научног истраживања у спорту и физичком васпитању. Године 2017. започиње рад као професор Методологије научног истраживања у спорту и физичком васпитању на студијском програму докторских академских студија на Факултету физичког васпитања и спорта Универзитета у Источном Сарајеву.

У јуну 2020. године изабран је у звање ванредног професора на Факултету спорта и физичког васпитања Универзитета у Нишу. Од 2018. године обавља функцију продекана за науку и међународну сарадњу, Шефа докторских академских студија и Председника Центра за мултидисциплинарна истраживања на истом факултету.

У периоду од 2006. до 2008. године радио је као члан међународног тима за организацију спортско-рекреативних активности у компанији Hapimag – Sea Garden Resort Bodrum у Турској. Члан је секције за Историју физичког васпитања и спорта у ФИЕП-у (Federation Internationale D’education Phisique). Поседује IVSS лиценцу инструктора скијања од 2014. године.

Од августа 2019. године члан је Управног одбора Рукометног клуба Железничар из Ниша. Као предавач учествовао је у програмима ЕРАСМУС+ на универзитетима у Румунији, Грчкој, Литванији и Бугарској. Био је научни истраживач у два национална пројекта Министарства просвете, науке и технолошког развоја Србије. Ангажован је као стручни саветник у пројектима посвећеним инклузији особа са инвалидитетом у спорт („И ми смо спортисти“), као и у пројектима спортског туризма у прекограничној сарадњи.

Учествовао је у пројектима Европске уније, попут ESF 3.102 Inclusion for Employment, и као предавач на УЕФА Б семинарима за фудбалске тренере. Објавио је више од 30 научних радова, од којих су неки објављени у најпрестижнијим међународним научним часописима. Био је члан организационих и научних одбора више међународних научних скупова.

Активно говори енглески језик. Поседује вештине у области научног истраживања, педагогије спорта, спортске аналитике и организације спортских догађаја.